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Incidence de Salmonella non-typhoïdique chez les animaux producteurs d’aliments, les aliments pour animaux et l’environnement associé en Afrique du Sud, –

Contexte La salmonellose non typhoïde continue de constituer une menace mondiale pour la santé humaine, principalement en provoquant des maladies d’origine alimentaire, et les animaux producteurs d’aliments sont les principaux réservoirs de nombreux sérovars pathogènes. Identifier les points de contrôle clés et générer des informations permettant une estimation future Méthodes Les échantillons ont été prélevés sur le bétail et la volaille dans les exploitations agricoles, la viande dans les abattoirs, les matières premières dans les provenderies, les aliments pour animaux et les sources environnementales, par exemple les poulaillers, les poulaillers et les poulaillers. abattoirs, usines d’aliments pour animaux, eau de à conformément aux protocoles de chaque établissement conformes aux normes ISO ISO / TS, ISO: et ISO: normes L’isolement et le sérotypage de Salmonella ont été effectués conformément à la portée de l’accréditation des laboratoires respectifs ISO / CEI: techniques standardRésultats Salmonella is isolat Salmonella Enteritidis était l’isolat le plus fréquent, avec% de viande provenant de volailles dans les fermes, la viande de volaille et les poulaillers, suivie de Salmonella Havana, avec%, principalement de l’environnement. échantillons Des sérotypes rarement associés à une maladie humaine Salmonella Idikan, Salmonella Salford et Salmonella Brancaster ont été isolés à des fréquences plus élevées que Salmonella Typhimurium, une cause fréquente de maladie humaine Des échantillons environnementaux représentaient% d’échantillons positifs pour SalmonellaConclusions Nous décrivons l’isolement fréquent de Salmonella La prévention de la salmonellose chez l’homme nécessite un contrôle efficace de Salmonella chez les animaux destinés à l’alimentation, ces données peuvent être utilisées pour faciliter la lutte contre Salmonella chez les animaux destinés à l’alimentation et par conséquent prévenir les infections humaines

Les infections causées par Salmonella enterica de sérotypes autres que Typhi et Paratyphi Une infection humaine par NTS demeure un problème de santé publique mondial malgré les progrès des mesures sanitaires, du traitement de l’eau et des normes de sécurité alimentaire au cours des dernières décennies. contrôle des STN chez les animaux destinés à l’alimentation, ce qui nécessite le contrôle des STN dans les aliments pour animaux et les animaux destinés à l’alimentation. La majorité des infections NST sont d’origine alimentaire, mais chaque année les infections sont contractées directement ou indirectement. Les infections chez les humains se manifestent généralement par une maladie diarrhéique Cependant, la maladie invasive du SNS est fréquente chez les nourrissons et les enfants, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées et est particulièrement fréquente en Afrique contraste, la salmonellose chez les animaux producteurs d’aliments bétail, la volaille et d’autres animaux hôtes se manifeste comme une auto-limite Les excréments fécaux des animaux producteurs d’aliments sont la principale source de contamination des aliments, de l’eau et de l’environnement, alors que le transport intestinal entraîne souvent la contamination des carcasses à l’abattage. Il est clair que la contamination par les salmonelles du bétail et de la volaille a un effet direct sur la commercialisation mondiale des animaux producteurs de denrées alimentaires et des aliments d’origine animale . Les bactéries Salmonella peuvent survivre plusieurs semaines dans un environnement sec ou même plusieurs mois dans l’eau. , d’où ils peuvent facilement être récupérés en utilisant des techniques microbiologiques standard Un système de surveillance robuste et rigoureux combiné avec des mesures de contrôle agressives et approfondies, par exemple traitement thermique obligatoire des aliments, nettoyage et désinfection de l’environnement, contrôle des rongeurs est le facteur clé d’un programme de surveillance du SNRC réussi chez les animaux destinés à l’alimentation, le succès étant mesuré Par conséquent, le SNRC est une cible d’un système intégré de surveillance des agents pathogènes d’origine alimentaire adoptant une approche «Une seule santé» et mis en œuvre dans le continuum «de la ferme à la table». La susceptibilité humaine varie largement selon le régime alimentaire et l’immunocompétence parmi d’autres facteurs; Par conséquent, tous les sérotypes de Salmonella sont pathogènes pour l’homme car il existe une gamme de doses infectieuses pour les sérovars.Pour soulager la salmonellose d’origine alimentaire, des stratégies globales de réduction des pathogènes avant la récolte sont appliquées dans la plupart des pays, notamment en Afrique du Sud. et Salmonella dans la viande de poulet CAC / GL -, qui existent depuis D’autres directives pour le contrôle du NTS dans le bœuf et le porc ont été récemment proposées à la troisième session du Comité du Codex sur l’hygiène alimentaire. International des Epizooties recommande la prévention et le contrôle de Salmonella chez les porcs commerciaux de la ferme à l’abattoir Groupe ad hoc de l’OIE sur les salmonelles chez les porcs, août, http: // wwwoieint / En Afrique du Sud, les mesures réglementaires de contrôle des NTS chez les animaux producteurs d’aliments sont ciblant la sous-espèce Salmonella enterica enterica sérotype Enteritidis chez les volailles en vertu de la Loi sur les zoonoses Ces mesures réglementaires sont complétées par un protocole de contrôle des mouvements déclenché par un foyer d’infection à Salmonella Enteritidis chez les volailles ou d’autres oiseaux. La surveillance microbiologique des aliments relève des règlements statutaires édictés par la loi sur les produits alimentaires, les cosmétiques et les désinfectants. En outre, la Loi sur la sécurité sanitaire des viandes exige l’application de stratégies préventives fondées sur le risque et la mise en œuvre de programmes de gestion de l’hygiène pour réduire, éliminer ou prévenir les dangers potentiels tels que Salmonella. En fait, Salmonella est maintenant définie dans la procédure opératoire standard pour la surveillance microbiologique de la viande importée en tant qu’agent biologique associé à une maladie grave ou à la mort, en particulier aux souches résistantes. à ou plus critique impor Il est recommandé de sérotyper tous les isolats de Salmonella pour sous-typer Salmonella à des fins épidémiologiques afin de faciliter la compréhension de la source des infections à Salmonella chez les humains, les animaux destinés à l’alimentation, les aliments pour animaux et les animaux destinés à l’alimentation. la fréquence de l’isolement des sérotypes du SNT par le bétail, la volaille, l’environnement et d’autres sources non humaines en Afrique du Sud Ces données faciliteront l’élaboration de stratégies de contrôle de la salmonellose dans la voie alimentaire, conduisant éventuellement à l’abaissement de l’incidence chez les humains

Méthodes

Collecte d’échantillons

La période d’échantillonnage s’étendait de janvier à décembre. L’échantillonnage est effectué conformément au protocole ISO-: et aux directives du Codex Alimentarius. L’échantillonnage a été effectué conformément au protocole standard de chaque établissement basé sur des directives conformes aux normes ISO pour la surveillance microbiologique du bétail et de la volaille; l’hygiène et le nettoyage de la viande et de l’environnement; , échantillonnage microbiologique des carcasses ; et échantillonnage environnemental

Bétail et volaille à la ferme

Les prélèvements rectaux ou les fèces fraîches ont été collectés sur des bovins, des moutons, des porcs et de la volaille et transportés sur des accumulateurs de froid ou des glacières vers le site de surveillance des salmonidés. Laboratoire accrédité pour le traitement Les températures des échantillons ont été confirmées à & lt; C lors de la présentation En transit, les écouvillons rectaux ont été conservés dans le milieu de transport d’Amies tandis que les fèces étaient dans les selles fécales sans milieu de transport. En plus des données prospectives, des données rétrospectives sur les éclosions de Salmonella Enteritidis chez les volailles provenant de la volaille ont été obtenues auprès de la Section de l’épidémiologie du Ministère de la Santé. Agriculture, sylviculture et pêche DAFF, Afrique du Sud

Surveillance d’abattoir

La surveillance de Salmonella dans les abattoirs est entreprise sous les auspices de la loi sur la sécurité des viandes, qui stipule que toute la viande doit être exempte de substances dangereuses et donc déclarée saine et propre à la consommation humaine. la volaille, ou l’autruche ou le crocodile de la faune producteur de nourriture ont été aseptiquement enlevés pour la transformation microbiologique De plus, des carcasses choisies au hasard ont été également écouvillonnées pour les isolats de Salmonella utilisant des éponges selon la pratique standard décrite

Alimentation animale et matières premières

Au moins g d’aliments pour animaux, à savoir farine d’os, farine de sang, farine de viande, farine de carcasse, farine de poisson, nourriture pour chats et chiens ou matières premières, farine, luzerne, maïs, soja, tournesol, suif, eau, et la levure ont été recueillies et soumises à des techniques sélectives et d’enrichissement pour Salmonella

Échantillons environnementaux

Les tampons et les écouvillons environnementaux ont été recueillis à l’aide de couvre-bottes en coton humidifié portés lors des activités routinières des poulaillers tels que la collecte des œufs et les aliments changeants. Les échantillons de moulins à farine, d’abattoirs et d’équipements de production associés ont été collectés à l’aide d’une plume ramassée dans la maison pour balayer suffisamment la poussière dans la bouteille d’échantillonnage. Lorsque disponibles, les coléoptères, les insectes et les grenouilles ont été recueillis dans le cadre d’une surveillance environnementale plus large. L’eau de l’environnement provenant des fermes ou des poulaillers a été échantillonnée

Culture et identification des isolats de Salmonella

L’isolement et le sérotypage de Salmonella ont été effectués en fonction de la portée de l’accréditation des laboratoires respectifs selon ISO / CEI: Les échantillons ont été testés selon ISO: Tous les isolats confirmés de Salmonella ont été sérotypés selon White-Kauffmann-Le Minor schéma utilisant des antisérums polyvalents O et H BD Diagnostics, Gauteng, Afrique du SudDes statistiques descriptives Microsoft Excel ont été utilisées pour calculer le pourcentage de fréquence d’isolation de chaque sérovar par source

RÉSULTATS

Fréquences des sérotypes de Salmonella

Un total d’échantillons ont été distribués comme suit, et des animaux, aliments pour animaux, sources environnementales, carcasses et sources non animales ont été reçus à l’unité de diagnostic Salmonella spécialisée pour le traitement entre janvier et décembre. La prévalence de l’isolement de Salmonella par an était de% dans ; de% dans, et de% dans Globalement, Salmonella a été isolé à partir de% échantillons, englobant les sérotypes de Salmonella Salmonella Enteritidis a été isolé à partir de% échantillons; Salmonella Havana à partir de%; suivi de Salmonella Idikan, Salmonella Salford et Salmonella Brancaster par ordre décroissant de prévalence Salmonella Typhimurium a été isolé à partir de% échantillons Tableau Salmonella Seftenberg, Salmonella Montevideo, Salmonella Ohio, Salmonella Muechen, Salmonella Schwarzengrund, Salmonella Anatum, Salmonella Mbandaka, Salmonella Hadar, Salmonella Infanits, et Salmonella Orion ont complété la liste des sérovars les plus fréquemment rencontrés au cours de la période étudiée Des échantillons positifs pour Salmonella, appartiennent à% sérovars peu communs

Tableau Fréquences des principaux sérotypes de Salmonella isolés des animaux producteurs de denrées alimentaires, viande, aliments pour animaux, environnement et autres sources non-humaines en Afrique du Sud, – Salmonella Serovar Animaux de ferme Animaux Viande Alimentation animale Autres sources Enteritidis La Havane Idikan Salford Brancaster Typhimurium Senftenberg Montevideo Muenchen Ohio Anatum Schwarzengrund Mbandaka Hadar Infantis Orion Autres sérotypes Total Salmonella Serovar Animaux de ferme Viande Aliments pour animaux Environnement Autres sources Total Enteritidis La Havane Idikan Salford Brancaster Typhimurium Senftenberg Montevideo Muenchen Ohio Anatum Schwarzen grund Mbandaka Hadar Infantis Orion Autres sérotypes Total View Large

Distribution des sérovars de Salmonella par source

Les échantillons positifs pour Salmonella Enteritidis provenaient principalement de la volaille, de la viande de volaille et de l’élevage de volailles. Des isolats de Salmonella Enteritidis provenant de produits carnés provenaient tous de volailles. Les isolats de Salmonella Enteritidis provenaient tous de poulets, pondeuses, œufs et embryons morts dans la coquille Des échantillons d’environnement positifs pour Salmonella Enteritidis, provenant principalement de coquilles d’œufs, de poussières de poulaillers, de fientes et de copeaux échantillonnés dans des poulaillers. Des isolats de Salmonella Havana,% ont été isolés de l’environnement, avec% provenant de poulaillers, d’abattoirs et d’usines d’aliments, collectivement d’isolats de Salmonella Salford,% provenaient d’aliments pour animaux et spécifiquement des matières premières Tableau d’isolats de Salmonella,% d’aliments pour animaux,% d’aliments pour animaux et% de chiens ou de chats aliments

Tableau Répartition des sources d’échantillons positifs pour Salmonella traités dans les laboratoires de diagnostic en Afrique du Sud, – Catégorie Sources réelles Nombre d’isolats Total Animaux de ferme Poulets de chair, pondeuses, reproducteurs, morts-nés, etc. Bovins Viandes Volailles, carcasses de viande , sous-produits de boeuf de porc Crocodile autruche aliments pour animaux farine d’os d’alimentation, farine de poisson, farine de sang, etc matières premières soja, la levure, le tournesol, le maïs, etc. nourriture pour chiens / chats Environnement poulaillers excréments, de la poussière, des copeaux, coquilles d’œuf, peluches, etc. abattoirs provenderies eau Autres sources non définies scarabées Litter Frog total Catégorie sources réelles Aucun des isolements total des animaux de ferme volaille poulets de chair, les couches, les animaux reproducteurs, mort en coquille, etc. carcasses des bovins de viande de volaille de la viande, les coupes, les sous-produits de boeuf de porc Crocodile autruche alimentation animale Nourrir la farine d’os, f ish repas, repas de sang, etc Matières premières soja, la levure, le tournesol, le maïs, etc. Aliments pour chiens / chats Environnement Volaille maisons excréments, de la poussière, des copeaux, coquilles d’œuf, peluches, etc. Abattoirs Provenderies eau D’autres sources non définies scarabées Litter Frog total Voir Grande proportion d’isolats de Salmonella Typhimurium provenant de l’environnement, suivie de% d’animaux d’élevage, de% d’aliments pour animaux et de% d’isolats de viande d’isolat de Salmonella,% d’isolats environnementaux de Salmonella,% de viande de volaille des échantillons de maisons comprenant de la poussière, des copeaux, des excréments et des coquilles d’œufs; % provenaient d’abattoirs et% provenaient d’usines d’aliments pour animaux. Un total de% des échantillons provenait de sources non définies obtenues dans le cadre d’une enquête environnementale plus large

Tendances rétrospectives des éclosions de Salmonella Enteritidis

Les données de la Section d’épidémiologie, DAFF, Afrique du Sud, ont montré qu’il y avait des foyers chez la volaille de Salmonella Enteritidis dans, dans, et Figure

Figure View largeTableau de téléchargementNombre de foyers de Salmonella enterica sous-espèce enterica serovar Enteritidis chez les volailles déclarés en Afrique du Sud pour la période -Figure Voir grandTableau de téléchargementNombre de foyers de Salmonella enterica sous-espèce enterica serovar Enteritidis chez les volailles déclarées en Afrique du Sud pour la période –

DISCUSSION

Comme le SNRC chez les animaux se manifeste habituellement comme une maladie subclinique, des contrôles de Salmonella pré-récolte réussis avec échantillonnage rigoureux et actions consécutives résultant des résultats de l’échantillon sont nécessaires. La recherche devrait viser à mieux comprendre la dynamique de transport et de transmission des salmonelles chez les animaux. Cela aidera à l’élaboration de stratégies visant à réduire l’excrétion fécale avant la récolte et la contamination subséquente des carcasses à l’abattage. Un écart dans la normalisation des méthodologies et des critères d’évaluation des méthodes de surveillance entre les secteurs et les départements en Afrique du Sud. Les données de surveillance du SNRC pour le bétail et la volaille en Afrique du Sud ont été rapportées pour la période de -, où Salmonella Typhimurium était le plus fréquemment isolé chez les volailles et Salmonella Dublin était deuxième chez les volailles, mais plus élevé chez les bovins [ ] Nous par conséquent, se concentrer sur la période à partir de dans la présente étude, en raison du manque de données pour le bétail dans les années suivantes après; Cependant, des données plus récentes montrent que l’épidémiologie de la salmonellose chez la volaille pourrait avoir changé au cours de la période de mise en évidence des risques et des facteurs de risque pour l’émergence de certains sérotypes de Salmonella. La présence de nouveaux sérovars de Salmonella en tête de liste n’a pas été surprenante, car les foyers de Salmonella Enteritidis ont fortement augmenté entre et Figure, peut-être en raison de l’amélioration de la surveillance obligatoire des salmonelles chez les volailles . l’importation de viande fraîche multispécifique au fil des ans de divers pays développés et en développement aurait pu modifier les tendances des sérotypes de Salmonella en Afrique du Sud. La surveillance active en laboratoire de Salmonella a été introduite au niveau national par la Loi sur la sécurité sanitaire des viandes. échantillonnage de routine tout au long de l’année sur des jours consécutifs pour asse L’efficacité des protocoles pour résoudre les problèmes de contamination des carcasses par les salmonelles dans les abattoirs et les usines de transformation exige que les abattoirs disposent d’un programme d’échantillonnage microbiologique opérationnel dans le cadre de leur plan de gestion de l’hygiène. En outre, ce test obligatoire a maintenant été étendu aux poulaillers, aux abattoirs, aux aliments pour animaux et aux matières premières, aux fabriques d’aliments pour animaux, ou même aux chargements de viande de volaille importée. La salmonelle n’a jamais été signalée auparavant en Afrique du Sud Les données présentées ici impliquent que l’environnement est une source importante de Salmonella, qui est donc l’un des points de contrôle clés nécessitant une intervention. Les poulaillers, les provenderies et les abattoirs doivent donc être régulièrement décontaminés. la transmission de Salmonella au nouveau flo La fréquence des sérovars dans ces régions d’Afrique du Sud aurait pu être biaisée en raison de la non-disponibilité des données des laboratoires d’État. Malgré cela, une moyenne de% des échantillons soumis aux laboratoires ont été testés positifs pour Salmonella pendant l’année. Cependant, les données provenant des rapports annuels du Groupe de surveillance des maladies entériques, respiratoires et méningococciques de l’Afrique du Sud et de l’Organisation mondiale de la santé mondiale sur les aliments d’origine végétale ne sont pas facilement identifiables. La base de données Infections Network a montré un doublement progressif des cas humains dus au NTS et, en particulier, à Salmonella Enteritidis entre et Cependant, le lien entre les souches animales, environnementales et humaines peut être établi en utilisant des techniques moléculaires telles que le gel pulsé électrophorèse, comme cela a été récemment rapporté entre les souches humaines et captives sauvages animaux Une application généralisée de cette technique permettra la création d’une base de données régionale pour les pulsotypes PulseNet qui facilitera les enquêtes épidémiologiques rapidesEn conclusion, nos données fournissent un aperçu des sources potentielles de NTS dans la voie alimentaire de la ferme à l’assiette en Afrique du Sud. Pour atteindre les résultats optimaux en matière de santé humaine et animale, la collaboration et la communication au sein et entre les entités de microbiologie vétérinaire et humaine impliquées dans la prévention, la surveillance, la riposte aux flambées et la recherche sur les salmonelles doivent être encouragées. l’accord de partage du système d’information de santé publique mandaté par la loi entre les disciplines de santé animale et humaine dans le cadre «Une santé» devrait être considéré comme la meilleure approche pour un contrôle efficace de la salmonellose

Remarques

Remerciements Nous remercions les autorités de réglementation, en particulier DAFF et l’Autorité nationale pour les spécifications obligatoires, ainsi que les laboratoires gouvernementaux et privés d’Afrique du Sud qui ont fourni des données pour permettre cette révision. Un grand merci au personnel de la Direction de la santé publique vétérinaire Dr Tembile Songabe et Dr Mphane Molefe et vétérinaires des services d’inspection stationnés dans les différents ports d’entrée pour leur soutien dans la publication de cet ouvrageDisclaimer Les opinions, commentaires et conclusions exprimés dans cet article sont ceux des auteurs et ne reflètent pas nécessairement les opinions et conclusions de DAFF, Afrique du SudAide financière Ce travail a été soutenu par le projet de loi & amp; Melinda Gates Foundation OPP, qui a rendu cette publication possible. Parrainage de suppléments Cet article apparaît dans le supplément «Invasive Salmonella Disease in Africa», parrainé par l’Université d’Otago Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit d’intérêt potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Les conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués